ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Генетический полиморфизм госпитальных штаммов Staphylococcus epidermidis, выделенных у новорожденных отделения реанимации и интенсивной терапии

А. Б. Гордеев1, Л. А. Любасовская1, Ю. В. Родченко1, Д. В. Дубоделов1, И. С. Мукосей2, Т. О. Кочеткова2, И. В. Никитина3, О. В. Ионов3, В. В. Зубков3, Д. Ю. Трофимов2, Т. В. Припутневич1
Информация об авторах

1 Отдел микробиологии и клинической фармакологии,
Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В. И. Кулакова, Москва

2 Отдел клинической и молекулярной генетики,
Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В. И. Кулакова, Москва

3 Отдел неонатологии и педиатрии,
Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В. И. Кулакова, Москва

Для корреспонденции: Гордеев Алексей Борисович
ул. Академика Опарина, д. 4, г. Москва, 117997; ur.sertorp.agev@weedrog

Информация о статье

Финансирование: работа выполнена при поддержке Министерства образования и науки РФ (соглашение № 14.607.21.0019 от 05.06.2014,
шифр заявки 2014-14-579-0001-065).

Вклад авторов в работу: А. Б. Гордеев — проведение биоинформатического анализа нуклеотидных последовательностей, анализ литературы, подготовка черновика рукописи; Л. А. Любасовская — проведение микробиологических исследований, анализ литературы, интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; Ю. В. Родченко, Д. В. Дубоделов — проведение микробиологических исследований, подготовка черновика рукописи; И. С. Мукосей, Т. О. Кочеткова — полногеномное секвенирование и сборка нуклеотидных последовательностей; И. В. Никитина — планирование исследования, интерпретация данных; О. В. Ионов, В. В. Зубков — планирование исследования, организация взятия биологического материала; Д. Ю. Трофимов — планирование исследования, организация работы по полногеномному секвенированию; Т. В. Припутневич — планирование исследования, организация микробиологических исследований, интерпретация данных, подготовка черновика рукописи. Все авторы принимали участие во внесении исправлений в текст рукописи.

Статья получена: 02.02.2017 Статья принята к печати: 18.02.2017
|

Staphylococcus epidermidis — представитель нормальной микрофлоры человека, способный вызывать опасные заболевания у новорожденных с очень низкой и экстремально низкой массой тела при рождении. Различные штаммы S. epidermidis обладают разным спектром генов, ассоциированных с их резистентностью к антимикробным препаратам и патогенностью. По результатам анализа данных полных геномных секвенирований четырнадцати штаммов S. epidermidis изучено генетическое разнообразие штаммов, циркулирующих в отделении реанимации и интенсивной терапии новорожденных НЦАГиП им. В. И. Кулакова. Выявлена принадлежность штаммов к восьми сиквенс-типам, из которых чаще встречались ST2 и ST59, принадлежащие к единому клональному комплексу СС2. К данному клональному комплексу относились 10 из 14 штаммов. Показано, что изученные штаммы обладали широким спектром генов резистентности к антимикробным препаратам. Обнаружено 15 различных генов, обуславливающих резистентность штаммов к аминогликозидам, бета-лактамным антибиотикам, фузидиевой кислоте, макролидам, линкозамидам, стрептограмину B, тетрациклину и триметоприму. Выявлены гены, ассоциированные с патогенностью (aae, atlE, aap, embp), встречающиеся в геномах изученных штаммов с разной частотой. В геномах девяти штаммов был обнаружен инсерционный элемент IS256, а в геномах семи штаммов — гены ica-оперона, отвечающего за синтез белков матрикса биопленок.

Ключевые слова: резистентность, полиморфизм, полногеномное секвенирование, патогенность, Staphylococcus epidermidis, новорожденные, сиквенс-тип

КОММЕНТАРИИ (0)