ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Полиморфизм гена dtxR у современных штаммов Сorynebacterium diphtheriae

И. А. Чагина1, Ю. С. Переварова2, В. В. Переваров2, А. В. Чаплин2, О. Ю. Борисова1,2, Л. И. Кафарская2, С. С. Афанасьев1, В. А. Алешкин1
Информация об авторах

1 Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г. Н. Габричевского, Москва

2 Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова, Москва, Россия

Для корреспонденции: Андрей Викторович Чаплин
ул. Островитянова, д. 1, г. Москва, 117997; moc.liamg@kidemoloko

Информация о статье

Финансирование: исследование выполнено в рамках Отраслевой научно-исследовательской программы Роспотребнадзора на 2016–2020 гг. «Проблемно-ориентированные научные исследования в области эпидемиологического надзора за инфекционными и паразитарными болезнями» по проектам № А16-116021550311-2 «Изучение роли микробиоценозов ротоглотки и крови человека при дифтерии, коклюше и других инфекционно-воспалительных заболеваниях» и № АААА-А16-116101810127-7 «Разработка молекулярно-генетических методов лабораторной диагностики дифтерии и коклюша».

Вклад авторов в работу: И. А. Чагина — анализ литературы, сбор и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; Ю. С. Переварова, В. В. Переваров — анализ литературы, анализ и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; Д. А. Чаплин — планирование исследования, анализ и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; О. Ю. Борисова — планирование исследования, сбор и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; Л. И. Кафарская — интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; С. С. Афанасьев, В. А. Алешкин — планирование исследования, подготовка черновика рукописи. Все авторы принимали участие во внесении исправлений в текст рукописи.

Статья получена: 02.02.2017 Статья принята к печати: 18.02.2017 Опубликовано online: 11.03.2017
|
Дендрограмма филогенетических взаимоотношений гена dtxR у штаммов С. diphtheriae
Дерево изображено в масштабе, с длинами ветвей в тех же эволюционных расстояниях, которые использовались для построения филогенетического дерева. Масштаб соответствует 0,1 замене на 200 п. н. Последователь- ности внутри групп полностью идентичны.
Таблица 1. Частота встречаемости замен нуклеотидов в гене dtxR у исследованных штаммов C. diphtheriae относительно штамма PW8
Таблица 2. Комбинации полиморфизмов гена dtxR у штаммов C. diphtheria
Примечание. * — совпадение нуклеотида; T, А — полиморфизм с заменой аминокислоты.
Таблица 3. Состав групп в соответствии с комбинацией полиморфизмов в гене dtxR у штаммов C. diphtheriae
Примечание. * — МЛСТ не проводили, ‒ — ST не обнаружен в базе данных.