ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Генотипирование клинических изолятов Mycobacterium tuberculosis, выделенных в Московском регионе, методом MIRU-VNTR

Информация об авторах

Лаборатория генетики микроорганизмов, Отдел генетических основ биотехнологии,
Институт общей генетики имени Н. И. Вавилова РАН, Москва

Для корреспонденции: Даниленко Валерий Николаевич
ул. Губкина, д. 3, г. Москва, 119333; ur.ggiv@direlav

Информация о статье

Финансирование: работа выполнена в рамках двустроннего проекта Российского фонда фундаментальных исследований (№ 13-04-91444 «Токсины–антитоксины и RpsA в лекарственной устойчивости и персистенции микобактерий туберкулеза»).

Благодарности: авторы благодарят коллектив отдела микробиологии Центрального научно-исследовательского института туберкулеза (Москва) и, в частности, д. б. н. Ларису Черноусову за помощь в создании коллекции клинических изолятов M. tuberculosis.

Вклад авторов в работу: К. В. Шур — планирование эксперимента, сбор, анализ и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; Д. А. Маслов — планирование эксперимента, анализ и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; О. Б. Беккер, В. Н. Даниленко — планирование эксперимента, интерпретация данных, подготовка черновика рукописи.

Статья получена: 01.02.2017 Статья принята к печати: 24.03.2017
|

Под воздействием различных селективных факторов (применение антибиотиков, генетический полиморфизм и разнообразие иммунных статусов хозяина и др.) возбудитель туберкулеза Mycobacterium tuberculosis постоянно эволюционирует. Возникают новые линии и сублинии, характеризующиеся набором значимых и незначимых мутаций. Анализ и мониторинг представленности различных линий и их особенностей является важным для понимания эволюции патогена. В данной работе была использована коллекция из 46 клинических изолятов M. tuberculosis, выделенных в Московcком регионе. Была определена их генотипическая принадлежность к различным линиям и сублиниям типированием по 24 локусам MIRU-VNTR. Было показано преобладание изолятов линии Beijing в коллекции (60,9 %) и изолятов сублинии Beijing-B0/W148 (60,7 % внутри линии Beijing), характеризующихся множественной лекарственной устойчивостью (88,2 % изолятов в данной выборке). Также использованный метод позволил определить один предполагаемый случай смешанной инфекции.

Ключевые слова: генотипирование, Mycobacterium tuberculosis, филогенетика, эпидемиология, Beijing, MIRU-VNTR

КОММЕНТАРИИ (0)