DOI: 10.24075/brsmu.2017-02-02

ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Идентификация аминогликозидфосфотрансфераз клинических штаммов бактерий в микробиоте жителей России

А. С. Ковтун1,2, М. Г. Алексеева1, О. В. Аверина1, В. Н. Даниленко1,2,3
Информация об авторах

1 Лаборатория генетики микроорганизмов, Отдел генетических основ биотехнологии,
Институт общей генетики имени Н. И. Вавилова РАН, Москва

2 Факультет биологической и медицинской физики,
Московский физико-технический институт (государственный университет), Долгопрудный

3 Научно-исследовательский центр биотехнологии антибиотиков «БИОАН», Москва

Для корреспонденции: Даниленко Валерий Николаевич
ул. Губкина, д. 3, г. Москва, 119991; ur.ggiv@direlav

Информация о статье

Благодарности: авторы благодарят профессора Сергея Сидоренко из Северо-Западного государственного медицинского университета имени И. И. Мечникова за обсуждение

Вклад авторов в работу: А. С. Ковтун — анализ и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; М. Г. Алексеева — анализ литературы, планирование исследования, сбор и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; О. В. Аверина — сбор и интерпретация данных, подготовка черновика рукописи; В. Н. Даниленко — планирование исследования, интерпретация данных, подготовка черновика рукописи. Все авторы принимали участие во внесении исправлений в текст рукописи.

Статья получена: 29.03.2017 Статья принята к печати: 07.04.2017
|

Устойчивость бактерий к антибиотикам является одной из самых серьезных проблем в современной медицине. Эффективность антимикробной терапии снижается вследствие работы бактериальных ферментов — аминогликозидфосфотрансфераз (Aph). Гены aph аннотированы в геномах многих бактерий, в том числе комменсалов микробиоты кишечника, из геномов которых они могут попадать в геномы клинически значимых штаммов. Анализ in silico 11 метагеномов кишечника здоровых людей из России показал наличие в 7 образцах микробиоты 3 генов aph из 21, включенного в каталог, составленный для исследования: aph(3'')-Ib, aph(3')-IIIa и aph(2'')-Ia. Наиболее распространенным оказался ген  aph(3')-IIIa, найденный в 6 исследованных метагеномах. Важно, что этот ген впервые был обнаружен у Enterococcus faecalis, но в данной работе он был идентифицирован в генетическом окружении, характерном для комменсальной бактерии Ruminococcus obeum и условно-патогенных бактерий Enterococcus faecium, Roseburia hominis, Streptococcus pyogenes и Staphylococcus epidermidis.  То же наблюдали для гена aph(2'')-Ia: он был обнаружен для Clostridium difficileа не для E. faecalis. Полученные результаты согласуются с литературными данными, указывающими на значимое влияние географического происхождения людей на распространенность aph-генов. Также, учитывая данные исследования, представляется обоснованным при клиническом обследовании пациентов с инфекционными заболеваниями и назначении антибиотиков для их лечения анализировать антибиотикорезистентность не только бактерии-возбудителя, но и микробиоты пациента.

Ключевые слова: антибиотикорезистентность, устойчивость к антибиотикам, аминогликозидфосфотрансферазы, Aph, клинические штаммы бактерий, микробиом, микробиота, кишечник человека

КОММЕНТАРИИ (0)