ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Влияние выбора числа покрытий при секвенировании на точность определения единичных нуклеотидных вариантов

Информация об авторах

ООО «Генотек», Москва

Для корреспонденции: Ильинский Валерий Владимирович
Наставнический пер., д. 17, стр. 1, г. Москва, 105120; ur.ketoneg@yrelav

Информация о статье

Благодарности: авторы благодарят Анну Давыдову из «Генотек» за помощь в написании статьи.

Вклад всех авторов в работу равнозначен: подбор и анализ литературы, планирование структуры статьи, интерпретация данных литературы, подготовка черновика рукописи, внесение исправлений.

Статья получена: 22.06.2017 Статья принята к печати: 27.06.2017 Опубликовано online: 19.07.2017
|
Рис. 1. Распределение валидированных и невалидированных Сэнгером мутаций по покрытию и доле ридов, поддерживающей альтернативный аллель. Одной точке может соответствовать более одной мутации
Рис. 2. Кумулятивное распределение доли образцов, имеющих долю ридов, поддерживающих альтернативный аллель X или менее
Рис. 3. Доля таргетных регионов, покрытых 12x, в зависимости от среднего покрытия таргетных регионов. Каждая точка соответствует одному образцу
Варьирование числа и доли ридов для отсечки референсных и альтернативных гомозигот