DOI: 10.24075/vrgmu.2018.016

ОБЗОР

CRISPR-Cas системы Mусоbacterium tuberculosis: структура модуля, изменение в процессе эволюции у различных линий, возможная роль в формировании вирулентности и лекарственной устойчивости

Информация об авторах

1 Лаборатория генетики микроорганизмов,
Институт общей генетики имени Н. И. Вавилова Российской академии наук, Москва

2 Кафедра биоинформатики, факультет биологической и медицинской физики,
Московский физико-технический институт (государственный университет), Долгопрудный

Для корреспонденции: Зайчикова Марина Викторовна
ул. Губкина, д. 3, г. Москва, 119991; ur.xednay@51zaniram, ur.ggiv@direlav

Статья получена: 15.03.2018 Статья принята к печати: 20.03.2018
|

CRISPR-Сas системы широко распространены у бактерий и архей. Они обеспечивают адаптивный иммунитет к бактериофагам и плазмидам, а также выполняют другие функции, включая регуляцию экспрессии генов, репарацию ДНК, формирование вирулентности. Нами был проведен анализ CRISPR-Сas систем полностью секвенированных геномов Mусоbacterium tuberculosis из семи линий: Beijing, B0/W-148, EAI, Haarlem, Ural, LAM, S. Проанализированные геномы содержат CRISPR-Сas систему типа III-A. Линиям в составе вида M. tuberculosis свойственны различия в строении CRISPR-Сas системы, в том числе редукция части системы у линии Beijing. Для cas-генов нами был осуществлен поиск возможных функциональных партнеров и компенсаторных механизмов с использованием метода филогенетического профайлинга. В ходе анализа филогенетических профилей (ФП) были обнаружены гены со сходным характером эволюционных событий. Установлено, что потеря части системы CRISPR-Cas у представителей линии Beijing сопровождалась по крайней мере двумя эволюционными событиями потери и одним событием приобретения участков генома. Возможность изучения альтернативных функций CRISPR-Сas систем у M. tuberculosis и их предполагаемая связь с другими генными системами представляет значительный интерес.

Ключевые слова: Mycobacterium tuberculosis, системы CRISPR-Cas, вирулентность, линия Beijing, филогенетический профайлинг, CRISPR-Cas

КОММЕНТАРИИ (0)