ISSN Print 2070–7320
ISSN Online 2070–7339
Вестник РГМУ
НАУЧНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ЖУРНАЛ РНИМУ ИМЕНИ Н. И. ПИРОГОВА
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Изоформы микроРНК miR-148a и miR-203a предположительно играют роль супрессоров колоректального рака
Информация об авторах
1 Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики», Москва, Россия
2 Институт молекулярной биологии Национальной академии наук Республики Армения, Ереван, Армения
Для корреспонденции: Степан Ашотович Нерсисян
ул. Вавилова, д. 7, г. Москва, 117312, Россия; ur.esh@naysisrens
Информация о статье
Финансирование: исследование осуществлено в рамках Программы фундаментальных исследований НИУ ВШЭ.
Благодарности: Алексею Галатенко из лаборатории молекулярной физиологии НИУ ВШЭ за критику авторских идей и ценные замечания.
Соблюдение этических стандартов: исследование проведено с соблюдением этических принципов Хельсинкской декларации Всемирной медицинской ассоциации.
Статья получена: 29.04.2022
Статья принята к печати: 22.05.2022
Опубликовано online: 30.05.2022
|
Рис. 1. Распределение экспрессии 55 наиболее экспрессированных 5’-изоформ микроРНК в выборке образцов колоректального рака. Горизонтальный отрезок внутри ящика отображает медиану распределения, границы ящиков соответствуют нижнему и верхнему квартилям, а вертикальные отрезки за пределами ящика продолжаются до минимального и максимального значения экспрессии
Рис. 2. Регуляторная сеть взаимодействий изоформ микроРНК, их мишеней и транскрипционных факторов. Синим, зеленым и красным цветом выделены 5’-изоформы микроРНК, транскрипционные факторы и гены, соответственно. Цвета ребер соответствуют цветам соответствующих регуляторов. Размеры вершин линейно соответствуют их степеням
Рис. 3. Сильно связная подсеть взаимодействий 5’-изоформ микроРНК и транскрипционных факторов. Эллипсами и прямоугольниками обозначены изоформы микроРНК и транскрипционные факторы соответственно. Стрелки обозначают активацию экспрессии, Т-образные линии обозначают подавление экспрессии
Таблица. Число предсказанных мишеней высокоэкспрессированных канонических микроРНК и соответствующих 5’-изоформ
