ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ

Сравнительный биоинформатический анализ состава генов антимикробной устойчивости в геномах представителей рода Corynebacterium

Т. А. Кульшань, И. О. Бугаева, Е. Ф. Соболева, М. С. Аллянова, Д. А. Попов, И. Г. Швиденко
Информация об авторах

Саратовский государственный медицинский университет имени В. И. Разумовского Министерства здравоохранения Российской Федерации, Саратов, Россия

Для корреспонденции: Татьяна Алексеевна Кульшань
ул. Б. Казачья, д. 112, г. Саратов, 410012, Россия; ur.xednay@nahsluk.anajtat

Информация о статье

Вклад авторов: Т. А. Кульшань — планирование исследования, анализ литературы, работа с молекулярно-генетическими данными (подбор геномов, аннотация генома, сравнительный анализ аминокислотной последовательности гена gyrA), аналитическая работа с полученными данными, написание публикации; И. О. Бугаева — планирование исследования, аналитическая работа с полученными данными, интерпретирование результатов, участие в написании публикации; Е. Ф. Соболева — анализ литературы, аналитическая работа с полученными данными, написание публикации; М. С. Аллянова — анализ литературы, анализ состава генов антимикробной устойчивости в геномах штаммов коринебактерий, работа с онлайн-сервисом PATRIC; Д. А. Попов — анализ литературы, поиск аминокислотных последовательностей гена gyrA в геномах коринебактерий, сравнительный анализ аминокислотных последовательностей; И. Г. Швиденко — консультирование в ходе написания статьи, аналитическая работа с полученными данными.

Статья получена: 20.10.2023 Статья принята к печати: 03.12.2023 Опубликовано online: 19.12.2023
|
Рис. Аминокислотная последовательность гена gyrA штаммов рода Corynebacterium, взятых в качестве примера. Рамкой выделены позиции точечных мутаций в аминокислотной последовательности гена gyrA, влияющие по литературным данным на повышение минимальной подавляющей концентрации (МИК) к хинолонам/фторхинолонам
Таблица 1. Штаммы представителей рода Corynebacterium, полногеномные нуклеотидные последовательности которых использованы в работе
Таблица 2. Перечень генов устойчивости к антимикробным препаратам, обнаруженных в геномах изучаемых штаммов рода Corynebacterium с помощью онлайн-ресурса PATRIC
Таблица 3. Перечень генов устойчивости к антимикробным препаратам, отсутствующих в геномах изучаемых штаммов рода Corynebacterium