ISSN Print 2070–7320
ISSN Online 2070–7339
Вестник РГМУ
НАУЧНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ЖУРНАЛ РНИМУ ИМЕНИ Н. И. ПИРОГОВА
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Определение оптимальных параметров предварительной обработки данных масс-спектрометрии с прямой ионизацией в нейрохирургии
Информация об авторах
1 Московский физико-технический институт, Москва, Россия
2 Федеральный исследовательский центр химической физики имени Н. Н. Семенова Российской академии наук, Москва, Россия
3 Сколковский институт науки и технологий, Москва, Россия
4 Сибирский государственный медицинский университет, Томск, Россия
Для корреспонденции: Денис Сергеевич Заворотнюк
Институтский переулок, д. 9, 141701, г. Долгопрудный, Московская область; moc.liamg@kuyntorovaz.sined
Информация о статье
Финансирование: работа выполнена в рамках государственного задания Министерства науки и высшего образования (соглашение № 075-03-2022-107, проект № 0714-2020-0006). Исследование выполнено с использованием оборудования ЦКП ФИЦ ХФ им. Н. Н. Семенова РАН.
Вклад авторов: Д. С. Заворотнюк — анализ и интерпретация данных, создание программного обеспечения, написание и редактирование рукописи; А. А. Сорокин — планирование исследования, анализ и интерпретация данных, редактирование рукописи; Д. С. Бормотов — сбор и интерпретация данных, написание рукописи; В. А. Елиферов — финансовое обеспечение эксперимента; К. В. Бочаров — сбор данных; С. И. Пеков — планирование исследования, анализ и интерпретация данных, редактирование рукописи. И. А. Попов — руководство проектом, обеспечение финансирования.
Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом НМИЦН имени Н. Н. Бурденко (протоколы № 40 от 12 апреля 2016 г. и № 131 от 17 июля 2018 г.), проведено в соответствии с принципами Хельсинкской декларации (2000 г.) и ее последующих пересмотров. Все пациенты подписали добровольное информированное согласие на участие в исследовании и использование биоматериалов в исследовательских целях.
Статья получена: 19.12.2024
Статья принята к печати: 03.03.2024
Опубликовано online: 27.04.2024
|
Рис. 1. Сравнение пиков масс-сканов опухолевых и неопухолевых образцов
Рис. 2. Принт-скрин окна приложения Mass-spectrum observer с панелью управления параметрами предварительной обработки спектров
Рис. 3. Принт-скрин окна приложения Mass-spectrum observer с графиками, соответствующими спектрам после процедуры предварительной обработки
Рис. 4. Определение положения пиков. Появление пиков, расстояние между которыми меньше, чем два разрешения прибора при данном режиме регистрации ионов (дублирующиеся пики), в масс-скане отрицательных ионов широкого диапазона низкого разрешения при неоптимальных значениях параметров обработки
Рис. 5. Определение положения пиков. Пропуск значимого пика в масс-скане отрицательных ионов узкого диапазона высокого разрешения при неоптимальных значениях параметров обработки
Таблица 1. Оптимальные значения SNR, соответствующие LASSO-моделям с минимальным значением AIC
Таблица 2. Списки возможных значений параметров HWS, TA, TBP
Таблица 3. Оптимальные параметры HWS, TA, TBP, полученные с помощью экспертной оценки
