ISSN Print 2070–7320
ISSN Online 2070–7339
Вестник РГМУ
НАУЧНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ЖУРНАЛ РНИМУ ИМЕНИ Н. И. ПИРОГОВА
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Определение оптимальных параметров предварительной обработки данных масс-спектрометрии с прямой ионизацией в нейрохирургии
Информация об авторах
1 Московский физико-технический институт, Москва, Россия
2 Федеральный исследовательский центр химической физики имени Н. Н. Семенова Российской академии наук, Москва, Россия
3 Сколковский институт науки и технологий, Москва, Россия
4 Сибирский государственный медицинский университет, Томск, Россия
Для корреспонденции: Денис Сергеевич Заворотнюк
Институтский переулок, д. 9, 141701, г. Долгопрудный, Московская область; moc.liamg@kuyntorovaz.sined
Информация о статье
Финансирование: работа выполнена в рамках государственного задания Министерства науки и высшего образования (соглашение № 075-03-2022-107, проект № 0714-2020-0006). Исследование выполнено с использованием оборудования ЦКП ФИЦ ХФ им. Н. Н. Семенова РАН.
Вклад авторов: Д. С. Заворотнюк — анализ и интерпретация данных, создание программного обеспечения, написание и редактирование рукописи; А. А. Сорокин — планирование исследования, анализ и интерпретация данных, редактирование рукописи; Д. С. Бормотов — сбор и интерпретация данных, написание рукописи; В. А. Елиферов — финансовое обеспечение эксперимента; К. В. Бочаров — сбор данных; С. И. Пеков — планирование исследования, анализ и интерпретация данных, редактирование рукописи. И. А. Попов — руководство проектом, обеспечение финансирования.
Соблюдение этических стандартов: исследование одобрено этическим комитетом НМИЦН имени Н. Н. Бурденко (протоколы № 40 от 12 апреля 2016 г. и № 131 от 17 июля 2018 г.), проведено в соответствии с принципами Хельсинкской декларации (2000 г.) и ее последующих пересмотров. Все пациенты подписали добровольное информированное согласие на участие в исследовании и использование биоматериалов в исследовательских целях.
Статья получена: 19.12.2024
Статья принята к печати: 03.03.2024
Опубликовано online: 27.04.2024
|
Радикальное удаление опухоли до сих пор остается наиболее эффективным методом лечения онкологических заболеваний головного мозга. Задачи интраоперационного мониторинга на сегодняшний день решают с помощью позитронно-эмиссионной томографии, магнитно-резонансной томографии и гистохимического анализа, однако они требуют применения дорогостоящего оборудования высококвалифицированным персоналом, поэтому до сих пор не получили широкого распространения. В качестве альтернативы возможно применение методов масс-спектрометрии без пробоподготовки с последующим анализом масс-спектрометрических данных методами машинного обучения. Так как для масс-спектрометрии без пробоподготовки характерны более богатые и разнообразные по количеству пиков спектры, ее применение требует специальной предварительной обработки экспериментальных данных. Целью исследования было разработать методы определения оптимальных значений параметров предварительной обработки данных масс-спектрометрии без пробоподготовки. В работе представлены два таких метода, а также приведены конкретные значения параметров для данных, полученных с помощью масс-спектрометра Thermo LTQ XL Orbitrap ETD.
Ключевые слова: масс-спектрометрия, прямая ионизация, анализ данных, предварительная обработка данных